平台使用說明

介紹如何使用 ATrISys 病理數位平台工具。

9 minutes

1. 模型訓練與推論

1.1 演算法訓練

於專案頁面中,點選左側 分析 欄位進入演算法區域。

在此畫面中分為兩部分:

上方:演算法 → 用於推論

下方:訓練用演算法 → 用於模型訓練

ana


開始訓練

於下方 訓練用演算法 中選擇欲訓練的模型

點擊 啟動新分析 開始設定訓練任務

系統目前提供以下演算法類型:

  • YOLO(物件偵測 / 影像分割)
  • SAM(智慧分割)
  • ResNeXt(影像分類)

訓練可設定的參數

  1. 訓練資料來源

    • 輸入訓練影像 ID
    • 或直接全選專案內影像
    • 可...
8 minutes

1. 影像上傳

  1. 於首頁側欄選擇 儲存空間,即可上傳影像至指定專案。
  2. 點選 新增檔案 後,選擇要上傳之 WSI 檔案。
  3. 下方的儲存空間區域會顯示所有已上傳的影像清單。

您也可以於: 專案空間 → 左側列表 影像
查看每個影像的詳細資訊,包括:

  • 影像名稱
  • 縮圖
  • 放大倍率
  • 標註數量
  • 上傳者與建立時間

upload


2. 影像標註

進入專案後,點擊左側 影像 欄位中的任一影像,即可開始標註。

2.1 標註工具列(上方)

平台提供多種標註工具:

  • 手繪線
  • 多邊形
  • 手繪多邊形
  • 圓形
  • 矩...
9 minutes

1. 系統簡介

ATrISys 是一套基於 Cytomine 開發的病理影像管理與標註平台,適用於 Whole Slide Image (WSI) 之:

  • 影像儲存與管理
  • 多層級視覺化瀏覽
  • 標註、量測、分類
  • 多人協作標註
  • AI 訓練資料準備

平台支援多名研究者同時於同一張影像上進行註記,並提供完備的權限管理與專案控管功能。


2. 登入與基本介面

2.1 登入系統

ATrISys 目前提供 Demo 預約服務。 若欲使用本平台,請至申請表單填寫資料。我們將在審核後提供帳號密碼以供登入使用。
⚠️ 登入後,建議至個人帳號頁面設定個人資訊與密...

22 minutes

1. API 是什麼?可以拿來做什麼?

ATrISys 建立於 Cytomine 之上,提供一組 HTTP API,讓使用者可以透過程式自動化操作平台,包括:

  • 列出專案、影像、標註
  • 批次下載標註(做 AI 訓練用 dataset)
  • 批次建立/更新標註
  • 整合到自己的分析程式或 pipeline

以下提供 api 基本操作,詳細操作請至 Cytomine 官方文件

2. API 需要資訊

使用 API 前,至少需要下列四個資訊:

  1. Host(主機位址): https://www.asynapse.xyz
  2. Public key(公開金鑰)/ P...